Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms