Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLIRPQ9GZT3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLIRPQ9GZT3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms