Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms