Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SNHG12Q9BXW3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms