Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VN1R3Q9BXE9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VN1R3Q9BXE9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms