Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIRIP3Q9BW71 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms