Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUP58Q9BVL2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms