Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms