Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 AMBRA1-205ENST00000526606 522 ntTSL 416.04■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 46.7
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DGCR8Q8WYQ5 AMBRA1-210ENST00000531542 561 ntTSL 312.01□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 SEMA4D-213ENST00000455551 3594 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 SEMA4D-221ENST00000537934 2710 ntTSL 212.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 SEMA4D-209ENST00000429836 2895 ntTSL 212.11□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 SEMA4D-201ENST00000339861 4258 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.521e-6■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 SEMA4D-207ENST00000420987 4275 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.235e-10■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.215e-10■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.25e-10■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.25e-10■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.155e-10■■■■■ 46.7
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DGCR8Q8WYQ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.085e-10■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.055e-10■■■■■ 46.7
DGCR8Q8WYQ5 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 312.56□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 46.6
DGCR8Q8WYQ5 LRRC8C-203ENST00000479252 2993 ntTSL 1 (best)16.86■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 46.6
DGCR8Q8WYQ5 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.99e-7■■■■■ 46.6
DGCR8Q8WYQ5 PDE2A-208ENST00000485058 664 ntTSL 318.8■□□□□ 0.69e-7■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 PDE2A-219ENST00000540380 764 ntTSL 418.44■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 PDE2A-222ENST00000542969 611 ntTSL 418.13■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 PDE2A-210ENST00000535701 543 ntTSL 516.95■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 PDE2A-214ENST00000537631 527 ntTSL 513.24□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.534e-7■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 CTIF-209ENST00000591387 859 ntTSL 216.58■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 CTIF-203ENST00000587752 683 ntTSL 513.74□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 46.5
DGCR8Q8WYQ5 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 34.16□□□□□ -1.742e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-202ENST00000319454 2011 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-231ENST00000449407 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-206ENST00000393528 3043 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-204ENST00000355634 4622 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 46.4
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.675e-12■■■■■ 46.3
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DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.485e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.425e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-220ENST00000519767 970 ntTSL 1 (best)23.03■■□□□ 1.285e-12■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 46.3
DGCR8Q8WYQ5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 46.3
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DGCR8Q8WYQ5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.486e-11■■■■■ 46.2
DGCR8Q8WYQ5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.36e-11■■■■■ 46.2
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DGCR8Q8WYQ5 PPP1CA-209ENST00000537694 882 ntTSL 514.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 46.1
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DGCR8Q8WYQ5 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 SLCO3A1-211ENST00000556649 617 ntTSL 311.99□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)9.71□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 NUDCD3-205ENST00000472246 570 ntTSL 48.68□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.553e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.923e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZADH2-204ENST00000582437 671 ntTSL 510.13□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZADH2-203ENST00000581620 520 ntTSL 49.5□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-237ENST00000636732 5073 ntTSL 513.35□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-202ENST00000392861 1514 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-210ENST00000440875 1809 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.983e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -13e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-206ENST00000427902 2236 ntTSL 1 (best)8.46□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-240ENST00000637267 2677 ntTSL 58.14□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.393e-6■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 AKAP13-211ENST00000559362 5459 ntTSL 217.7■□□□□ 0.423e-7■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 AKAP13-217ENST00000560302 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 AKAP13-216ENST00000560256 322 ntTSL 34.14□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 46.1
DGCR8Q8WYQ5 PTGDS-201ENST00000371623 921 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 46
DGCR8Q8WYQ5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 46
DGCR8Q8WYQ5 PTGDS-206ENST00000457950 661 ntTSL 316.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 46
DGCR8Q8WYQ5 PTGDS-210ENST00000640716 601 ntTSL 511.44□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 46
DGCR8Q8WYQ5 ERI3-205ENST00000457571 975 ntTSL 524.61■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 46
DGCR8Q8WYQ5 ERI3-203ENST00000452396 764 ntTSL 322.14■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 46
DGCR8Q8WYQ5 ERI3-209ENST00000495828 972 ntTSL 320.34■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 46
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