Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTF1AQ7RTS3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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