Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ALFQ53S48 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms