Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTTNQ14247 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTTNQ14247 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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