Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC27.51■■■□□ 2
GOLGA3Q08378 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA3Q08378 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms