Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXOSC9Q06265 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC9Q06265 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms