Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
UBE2MP61081 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.3 ms