Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TPTEP56180 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TPTEP56180 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TPTEP56180 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms