Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSNK1A1P48729 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms