Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GABRA5P31644 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms