Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GJB1P08034 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GJB1P08034 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GJB1P08034 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GJB1P08034 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB1P08034 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB1P08034 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB1P08034 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB1P08034 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB1P08034 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GJB1P08034 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms