Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TSPAN4O14817 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TSPAN4O14817 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TSPAN4O14817 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TSPAN4O14817 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TSPAN4O14817 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TSPAN4O14817 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TSPAN4O14817 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TSPAN4O14817 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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