Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BHMG1C9JSJ3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms