Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLDN25C9JDP6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms