Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K4Q9Y6R4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms