Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UTP11Q9Y3A2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UTP11Q9Y3A2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms