Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD1BQ9UPS6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD1BQ9UPS6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms