Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GTF2A1LQ9UNN4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms