Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms