Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RNF7Q9UBF6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RNF7Q9UBF6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RNF7Q9UBF6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RNF7Q9UBF6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RNF7Q9UBF6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RNF7Q9UBF6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RNF7Q9UBF6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RNF7Q9UBF6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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