Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG3Q9NT62 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG3Q9NT62 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms