Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARFGAP3Q9NP61 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms