Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL4Q9C0H6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL4Q9C0H6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms