Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RNF17Q9BXT8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms