Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NICN1Q9BSH3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NICN1Q9BSH3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms