Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RNF185Q96GF1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
RNF185Q96GF1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms