Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD2Q96BF3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIGD2Q96BF3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms