Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
KRTAP13-2Q52LG2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms