Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ECM1Q16610 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ECM1Q16610 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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ECM1Q16610 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ECM1Q16610 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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