Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMCO1Q147U7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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