Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUL1Q13616 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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