Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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