Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MKRN3Q13064 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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