Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC173Q0VFZ6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms