Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP4Q09028 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms