Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC26A5P58743 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC26A5P58743 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms