Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRE11P49959 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRE11P49959 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRE11P49959 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
MRE11P49959 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms