Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CASQ1P31415 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CASQ1P31415 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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