Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
VPREB1P12018 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms