Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLK3P07288 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLK3P07288 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLK3P07288 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms