Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP2O75323 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms