Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 RUVBL2-210ENST00000598768 497 ntTSL 59.21□□□□□ -0.945e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.563e-8■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.343e-8■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 IMMP2L-206ENST00000452753 421 ntTSL 510.05□□□□□ -0.83e-8■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 C20orf204-201ENST00000358393 1466 ntTSL 225.19■■□□□ 1.623e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 C20orf204-204ENST00000463337 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)21.55■■□□□ 1.043e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.983e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.373e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 56.11□□□□□ -1.433e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.613e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.73e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.743e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.983e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RNF126-207ENST00000605891 1671 ntTSL 529.63■■■□□ 2.335e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.135e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RNF126-203ENST00000589762 963 ntTSL 225.64■■□□□ 1.75e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-210ENST00000537947 1100 ntTSL 324.44■■□□□ 1.55e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.465e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 EPHA2-202ENST00000461614 875 ntTSL 223.82■■□□□ 1.45e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RNF126-205ENST00000591394 733 ntTSL 221.43■■□□□ 1.025e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.995e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.885e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GSDMD-216ENST00000534602 480 ntTSL 220.47■□□□□ 0.875e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 AJUBA-205ENST00000553736 751 ntTSL 219.15■□□□□ 0.665e-12■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-212ENST00000538437 747 ntTSL 218.68■□□□□ 0.585e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.445e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RNF126-206ENST00000592626 652 ntTSL 217.8■□□□□ 0.445e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RNF126-204ENST00000590885 1436 ntTSL 517.58■□□□□ 0.415e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-217ENST00000543089 506 ntTSL 1 (best)16.34■□□□□ 0.215e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GLCE-204ENST00000559798 1308 ntTSL 1 (best)16.02■□□□□ 0.165e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-204ENST00000535075 526 ntTSL 215.64■□□□□ 0.095e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 STARD10-219ENST00000544767 509 ntTSL 314.98□□□□□ -0.015e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.025e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 UQCC1-213ENST00000453855 1035 ntTSL 413.77□□□□□ -0.215e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 UQCC1-215ENST00000472559 1921 ntTSL 1 (best)13.74□□□□□ -0.215e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 UQCC1-214ENST00000457259 1987 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.385e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MSI2-217ENST00000583705 7612 nt12.27□□□□□ -0.455e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 UQCC1-210ENST00000424405 758 ntTSL 512.22□□□□□ -0.455e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 UQCC1-209ENST00000397556 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.545e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 AARS-203ENST00000565361 839 ntTSL 511.46□□□□□ -0.575e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.625e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.635e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 510.98□□□□□ -0.655e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 PAN2-210ENST00000548982 408 ntTSL 310.48□□□□□ -0.735e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PAN2-219ENST00000552868 469 ntTSL 310.41□□□□□ -0.745e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PAN2-209ENST00000548043 4641 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.775e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.95e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.646e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.36e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.611e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.561e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 DHRS2-207ENST00000556701 3157 ntTSL 1 (best)15.57■□□□□ 0.081e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 22e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.645e-12■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 DDX51-201ENST00000329073 2341 ntTSL 521.08■□□□□ 0.972e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.882e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.733e-9■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 FGFRL1-206ENST00000512174 571 ntTSL 319.39■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PIDD1-211ENST00000534649 754 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 FGFRL1-204ENST00000507339 562 ntTSL 417.94■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.435e-12■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.43e-9■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 DNMT3A-210ENST00000474807 840 ntTSL 517.48■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 CNOT9-204ENST00000432877 581 ntTSL 316.74■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PUF60-214ENST00000529693 684 ntTSL 216.7■□□□□ 0.262e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.265e-12■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NAA50-204ENST00000478020 473 ntTSL 416.2■□□□□ 0.185e-12■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NAA50-202ENST00000467022 520 ntTSL 415.95■□□□□ 0.145e-12■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NAA50-205ENST00000481432 958 ntTSL 315.95■□□□□ 0.145e-12■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 ATAD3B-205ENST00000485748 3233 ntTSL 215.47■□□□□ 0.072e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 OXA1L-204ENST00000431881 889 ntTSL 315.31■□□□□ 0.042e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 ATAD3B-204ENST00000474481 3367 ntTSL 215.23■□□□□ 0.032e-6■■□□□ 12.4
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